Todos sabemos bien que Yoda ira a Dagobath (O como se escriba) pero, ¿Porque? ¿Lucha con Palpetine? ¿Con Anakin? ¿Porque se marcha de Coruscant?

Esa es una de las incognitas que aún nos queda por resolver, por ahora sólo podemos conjeturar, y hay varios temas que tienen sus hipotesis, pero, realmente, nada se sabe.

porque ve el percal y huye cuando los jedis estan siendo exterminados

Yo creo que más bien será obligado a irse, igual que Obi Wan, por Mace Windu, mientras él da su propia vida defendiendo su retirada...

Pensemos que es un Maestro Jedi al cual es más fácil ocultarse, tiene un dominio de la fuerza superior a cualquiera, lo que le permite vivir de forma humilde como lo hace en Dagobah, no olvidemos también que es el Jedi más experimentado, por lo que sería el mejor maestro para Luke.

Me interesaría saber cual es la posición de Yoda al reswpecto, ¿Le guusta la idea?, ¿la propone él?, ¿mace Windu?, ¿Obi-Wan?, ¿Se resiste o acepta?. Son preguntas muy delicadas debido a que podría quedar de cobarde... puede ser un tema bastante difícil de resolver.

¿Y si despues de las guerras Clon se retira?
Justo cuando todo se esta transformando en imperio.

Si le da por dejar el cargo (no como al Sumo Pontifice Cristiano) tendria una salida "honrosa" cuando se iniciaran las hostilidades contra los Jedis. Pues ya no estaria.

Es solo una teoria por desarrollar.